??? 中国农业科学院、阿里云计算有限公司和湖南华智水稻生物技术有限公司日前在长沙宣布共同推动“云之稻项目”。3000份绿色超级稻基因组(简称水稻基因组)原始测序数据目前已部署在阿里云,这意味着全球科研用户不仅可以免费下载数据,还能直接在云端对这批数据进行分析和挖掘。
据了解,这是迄今为止全世界最大的植物基因组测序项目。该项目源自比尔·梅琳达盖茨基金“为非洲和亚洲资源贫瘠地区培育绿色超级稻”和国家国际合作专项资助的3000份水稻基因组项目的成果。根据协议,基于3000份水稻基因组测序数据的“云之稻项目”将无偿向全球共享数据,同时项目组还将建立最全面的“水稻功能基因组和育种信息数据库”,为基础研究和育种应用提供可供参考的重要信息。
中国农业科学院作物科学研究所黎志康博士介绍,项目总体目标是培育能够广泛适用于灌溉和雨养地区生态环境,并具有各种优势特性的水稻新品种,在目标国家进行示范和推广,推动杂交稻种子的生产能力,并为撒哈拉以南非洲国家、亚洲和中国的西南地区水稻分子育种建立一个高效水稻基因型分析技术平台。
“3000份水稻基因组代表了25万种子中95%的多样性,其重要性在于分析得到的数据将为水稻的基础认识和育种提供基础信息资源。”湖南华智水稻生物技术有限公司信息总监王冰冰介绍,目前,这份基因组分析得到的数据量达到几百TB(万亿字节),如按常规方式处理如此大规模的数据,单个研究团队、科研机构均会遇到下载难、存储难、分析难、运算难等问题,费时费力且成本高。这项研究将加快高产、优质、广适性新品种培育的进程,全面提升中国及全球水稻基因组研究和分子育种水平。
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2019-02-18 13:08:00