要改善番茄的风味，借泛基因组研究找回番茄原有风味

番茄是一年四季都有的蔬菜，我们也经常吃这一种蔬菜，那你有没有发觉，番茄的味道跟二十年前的番茄味，有很大的区别，现在的番茄味道淡，酸甜度都不太明显，也与现在的番茄种植方法也有一定的关系，你想不想吃到原有的番茄风味呢？

有不少民众发现，自商店购买的番茄似乎不如记忆中的味道，似乎已失去原有风味(flavor)。透过泛基因组(pan-genome)的研究，或许能找回番茄原先具有之风味，并理清风味变调的原因。泛基因组系指同一物种中，包含其品系、亚种等各个基因组在内的总集合。理清一个物种的泛基因组，有助于厘清物种的演化史及遗传背景，更有助于重建园艺品系间的亲缘关系。利用泛基因组的分析技术，加上演化学的观点，或许能进一步发现少数关键的基因。以美国农业部(U.S. Department of Agriculture)农业研究局(Agricultural Research Service)为首的研究团队，首次在番茄泛基因组研究上取得重大的研究成果。

　　研究团队利用少数已知品系的全基因组作为参考基因组，借此比对725个番茄品系并获取其中的基因组资讯。研究团队在比对的过程中发现有别于参考基因组中已知的基因，共发现4,873个新兴基因。据推测，这些消失在主流品系中的基因，可能是在先人驯化、育种及针对特定性状选拔等选汰压力下，面临严重的瓶颈效应，导致世代间发生基因丢失现象，许多遗传性状因此在世代间消失，令原本高遗传多样性的基因库逐渐丧失其多样性。所幸透过泛基因组的研究方法，研究团队得以找寻出育种过程中失去的遗传因子，并找回原有的风味。

　　在番茄中，TomLoxC负责生合成维生素A的前驱物，以及生合成与风味相关的挥发性有机脂肪酸。在番茄的泛基因组的研究结果中发现，TomLoxC某特定对偶基因(allele，又称作等位基因)仅存在于少数栽培品系或族群。虽然野生族群中有高达91%的比例拥有这型对偶基因，然而该对偶基因在主流的栽培品系中相当稀有，并仅存在于旧有的栽培品系中。研究团队推论，种植者为了选拔出高产量、长存放时间、抗病、抗旱等性状，在选汰的过程中忽略了与口感、风味相关的性状特征，这导致该对偶基因在世代间逐渐消失，形成低基因频率的罕见对偶基因(rare allele)。研究团队的重大发现，为逐渐消失的番茄风味提出合理的解释，并希望透过泛基因组的研究，提供育种者更全面的遗传背景。

现在泛基因组正在研究出原有风味的番茄，将在不久之后应该会上市，你一定要品尝泛基因组研究出原有风味的番茄，它的味道一定会给你惊喜哦！

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2019-05-29 15:24:53