一、病害
　　1、青霉菌：此病是由青霉菌通过鳞茎组织上的伤口侵入，并在储藏期传染。
　　症状：储藏期间，在鳞片腐烂斑点上长出白色的斑点，然后会长出绒毛状的绿蓝色斑块。被感染后，在整个储藏期间，甚至在-2℃的低温时，腐烂也会逐步增加。病菌将最终侵入鳞茎的基盘，使鳞茎失去价值或使植株生长迟缓。虽然受感染的鳞茎看起来不健康，但只要保证鳞茎基盘完整，那么在栽种期间植株的生长将不会受到影响。种植后，青霉菌的侵染不会转移到茎杆上，也不从土壤中侵染其他植株。
　　防治方法：不要种植那些基盘已被侵染的种球；感病的种球要尽快种植，种植前必须用千分之一克菌丹、百菌清、多菌灵等杀菌剂水溶液浸泡30分钟，然后定植；在种植前后，保持适宜的土壤湿度；将种球储藏在所推荐的最低温度。
　　2、种球、鳞片腐烂以及由镰刀菌引起的茎部病害：此病是由尖孢镰刀菌和自毁柱盘孢菌两种真菌引起。这些真菌通过伤口或寄生昆虫来浸染植株的地下部分，伤口主要是由鳞茎和茎根部裂开而造成的。这些真菌能在鳞茎上扩展，病菌也能通过土壤浸染，某些品种对浸染特别敏感。
　　症状：种球和鳞片腐烂的植株，其生长非常缓慢，叶片呈淡绿色。在地下，鳞片的顶部或鳞片与根盘连接处出现褐色斑点，这些斑点逐渐开始腐烂（鳞片腐烂）。如果根盘被侵染，那么整个鳞茎球就会腐烂。茎腐是镰刀菌侵染地上部的症状，识别的标志是基部叶片在未成年就变黄，变黄叶片以后变成褐色而脱落。在茎的地下部分，出现橙色到黑褐色斑点，以后病斑扩大，最后扩展到茎内部。之后茎部腐烂，最后植株未成年就死去。
　　防治方法:消毒被感染的土壤；尽可能快地把那些轻度或中度感染的鳞茎种完，土壤温度要低。
　　3、丝核菌：此病害由茄丝核菌引起。此真菌主要从土壤中浸染植株，在温度高于15℃、潮湿的条件下最活跃。此菌能为害许多其它植物，如郁金香、鸢尾、菊花和番茄，所以许多土壤会被丝核菌感染。
　　症状：如果感染轻微的话，只危害土壤中的叶片和幼芽下部的绿叶，叶片上出现下陷的淡褐色的斑点。一般来说，虽然植株的生长受一些影响，但仍能继续生长。感染严重的植株，它的上部生长受到妨碍，地下部白色叶片以及地上部最基部的叶片将会腐烂或萎蔫而落去，只在茎上留下褐色的疤痕。幼叶和生长点常常被危害，被感染的植株将抑制根茎发育，这反过来又阻碍了植株的生长，造成开花不理想或甚至没花，因为花芽在很早的阶段已干枯掉。
　　防治方法：用土壤消毒剂消毒已被怀疑感染的土壤，消毒后必须保证土壤不再受感染，特别是在夏季土壤温度高时；如果前茬作物已表现感染，就不能施用一般的土壤消毒剂，在种植前用防治丝核菌的药剂预先处理土壤（完全参入土壤10cm深处）。
　　4、疫霉病：此病通常由真菌烟草疫霉菌及其变种引起。在荷兰种球栽培业中未发现有疫霉菌。而在亚热带气候下，它对很多种类的植物都有影响，因而在大多数栽培土壤中都有此菌的存在。此菌在栽培过番茄和扶郎花的土壤中普遍存在，并可在潮湿土壤中生存许多年。土壤和植物太潮湿以及温度高（20℃以上）将促进此病发生。
　　症状：植株脚腐（疫霉菌）会妨碍生长或使其突然枯萎。茎基部被感染处产生软腐，成为暗绿色至褐色并向上扩展，叶片变黄，在茎基部开始失色。在地上的茎部也常发生类似软腐的感染，引起茎猝倒或弯曲。
　　防治方法：用一般土壤消毒剂消毒受感染的土壤；在栽培期间用控制腐霉菌的杀菌剂也能有效控制脚腐；保证土壤有良好的排水条件，防止作物在浇水后长期处于潮湿状态；在夏季土壤温度要尽可能最低。
　　5、腐霉病：此种根腐是由腐霉菌引起的。这种真菌在潮湿条件和温度20～30℃时很活跃。它们存在于土壤和鳞茎根上，不适宜的栽培条件，如差的土壤结构、土壤含盐量高或者土壤太湿会促进此病发生。
　　症状：此类菌可侵害一个区域内植株的根系，引起根腐，感病的植株矮小，下部叶片变黄，上部叶片变窄，叶色较淡，常萎蔫，尤其在高温蒸腾作用下更是如此。受根腐影响的植株，花芽干缩。这些植株在冬季常会有落蕾的现象。而且花较小，经常不能完全开放，或者花朵不易上色。如果将植株拔起，在种球和根茎部可见透明的、淡褐色腐烂斑点，或者它们已完全变软和腐烂。
　　防治方法：用一般土壤消毒剂消毒感染的或怀疑受感染的土壤；在栽培初期保持低的土壤温度，在整个栽培期间，采用正确的栽培步骤；在作物长出之后或可能已发生腐霉菌感染的情况下，可以用易于喷洒到作物上的防治腐霉病的杀菌剂，最好在傍晚进行；如果已观察到感染的话，保持尽可能最低的温室和土壤温度以限制作物的蒸腾，这可通过通风和遮荫来实现，土壤尽可能保持微湿。
　　6、葡萄球菌：由葡萄菌引起“火”斑。在潮湿的环境下，葡萄球菌会发育产生孢子，孢子可通过风或雨水而迅速传播到邻近植物上。孢子在干的植株上不会萌发，这样干的植株便不会被感染。
　　病症：在叶片上可见直径1～2mm的小黑褐色的圆点。在潮湿条件下这些圆点很快发展成较大的圆形或椭圆形的界线分明的斑点。这斑点在叶片两边肉眼可见。受感染的组织逐步死亡（凋谢而成纸状）。感染不但可从叶片中部开始，而且也可从叶缘开始，使叶片变成畸形，叶片生长受阻。茎也可被感染，最终芽完全腐烂或畸形发育。在感染的初期，在初感染芽的外层花瓣上会出现隆起的区域。已开的花对感染极其敏感，并出现灰色的、水浸状的、圆形的斑点，这些斑点成为“火斑”。
　　防治方法：尽量保持植株干燥，降低种植密度，增加通风和加热；病害易发生季节，可在早期交替使用防葡萄球菌的杀菌剂（如苯来特）；清除杂草和植株残余物，保证清洁卫生。
　　二、虫害
　　1、蚜虫
　　症状：受传染的植株，其底部的叶片发育正常，而上部的叶片在发育初期卷曲并呈畸形。蚜虫只危害幼叶，尤其是向下的叶片，也危害幼芽，产生绿色的斑点，花变得畸形并部分仍为绿色。
　　防治方法：清除杂草，因为杂草常常是蚜虫的寄主；若有蚜虫出现，每周用杀虫剂喷施作物。交替用药以防蚜虫产生抗药性。
　　三、生理性病害
　　1、叶烧：当植株吸水和蒸发之间的平衡被破坏时即会出现叶片焦枯。这是吸水或蒸腾不足时引起幼叶细胞缺钙的结果。细胞被损害并死亡。同时较差的根系、土壤中高的盐含量以及相对于根系来讲生长过快一样，温室中相对湿度的急剧变化会影响到这过程。敏感品种大球更加容易发生。
　　症状：首先，幼叶稍向内卷曲，数天之后，焦枯的叶片上出现黄色到白色的斑点。若叶片焦枯较轻，植株还可以继续正常生长，但若叶片焦枯很严重，白色斑点可转变成褐色，伤害发生处，叶片弯曲。在很严重的情况下，所有的叶片和幼芽都会脱落，植株不会进一步发育，这称之为“最严重的焦枯”。
　　防治方法：确保植株良好的根系；种植前应让土壤湿润；最好不要用敏感的品种，或采用小球；种植深度要适宜，在鳞茎上方应有6～10cm的土层；在敏感性增强的时间里，避免温室中的温度和相对湿度有大的差异，尽量保持相对湿度水平在75％左右；防止过速的生长；确保植株能保持稳定的蒸腾。
　　2、落蕾和花芽干缩：当植株不能得到充足的光照时会发生落蕾。在光照缺乏的条件下，花芽内的雄蕊产生乙烯，引起花芽败育。如果根系生存条件差，会增加蕾干缩的危险。
　　症状：在花蕾长到1～2cm时出现落蕾。花蕾的颜色转为淡绿色，同时，与茎相连的花梗缩短，随后花蕾脱落。在春季，低位花蕾首先受影响，而在秋季，高位花蕾将首先脱落。
　　花芽干缩在整个生长期中都会发生。花芽完全变为白色并变干。这些干花芽有时会脱落，假若在发育早期阶段出现花芽干缩，那么在以后会在叶腋上出现微小的白色斑点。
　　防治方法：不要将易落蕾的品种栽培在光照差的环境下；为防止花芽干缩，在栽培期间鳞茎不能干燥；确保植株的根系良好的生长。
　　3、缺素症：在百合的栽培过程中，可能会碰到一种或多种缺素的症状，其中有些可通过叶片颜色的变化进行判断。若及时地补充相应的元素，这些症状可被预防或缓解。
　　1）缺氮（N）
　　症状：植株生长迟缓；叶片为均匀的浅绿色到黄色。
　　解决方法：可使用速效氮肥较快调整过来，如硝酸钙〔Ca(NO3)2〕、尿素〔CO(NH2)2〕或硝酸钾（KNO3）。这些肥料可与灌溉水混合使用或进行喷施，然后进行淋洗。
　　2）缺钙（Ca）
　　症状：植株生长迟缓，叶片颜色变浅；叶尖向下弯曲，有时尖端变为褐色；叶片有时浅绿并带有白色斑点；根部发育不良。
　　解决方法：可在种植前在土壤中加入石灰来进行预防；还有一些其他的肥料也有助于减缓缺钙症状的发生，它们是：碳酸镁（MgCO3）、氧化镁(MgO)、氢氧化镁(Mg(OH)2)。
　　3）缺磷（P）
　　症状：植株生长迟缓；叶片颜色浅绿色，无光泽；老叶的尖端变为红褐色。
　　解决方法：栽培时缺磷较难补救。在栽培前土壤中磷的含量应该适宜，可使用磷酸氢钙（CaHPO4）来进行补充。该肥料中不含有氟。可在准备土壤前撒在土壤上。
　　4）缺钾（K）
　　症状：植株生长迟缓，而且有些矮；生长率不如正常植株；幼叶暗黄绿色，叶尖褐色；整个叶片上分布一些小的白色坏死斑点；再进一步，叶尖枯萎。
　　解决方法：可使用硝酸钾等肥料来进行弥补，该肥料可混合在灌溉液中提供。
　　5）缺镁（Mg）
　　症状：缺镁的表现较快，最老的叶片表现的最明显。主要表现为植株生长迟缓；叶片浅绿色并向下弯；有时沿叶片纵向有褐-白色斑点。
　　解决方法：可使用硫酸镁来进行补救，将其溶解在灌溉水中提供给植株，或直接喷撒在植株间的地面上。
　　6）缺铁（Fe）
　　症状：缺铁的症状在任何类型的土壤中都可能发生，在百合中，特别是东方杂交型和铁炮杂交型容易出现缺铁的症状。它们表现为：叶脉间发黄；症状主要集中在植株的上部；在生长速度较快的时候容易发生；严重时，铁炮杂交型百合的顶部叶片会变为白色。
　　解决方法：可使用螯合铁来进行预防。它们的效果主要取决于土壤中的pH值。较常用的两种螯合铁是EDDHA和DTPA。由于EDDHA适用的土壤pH范围在3.5～9，所以它可用于任何类型的土壤。DTPA适用的土壤pH范围为从酸性到7，当土壤中的pH值高于7时，它所起到的效果将大大降低。根据植株所表现出症状的严重程度，可在每平方米使用3～5克螯合铁。使用后，如果没有完全淋洗干净的话，EDDHA将在叶片上留下黑褐色的斑点。DTPA可与肥料一起使用，这种螯合铁有3％和6％两种形式。因为太阳光会使螯合铁分解，溶解好的螯合铁应注意避免阳光的照射。
　　7）缺锰（Mn）
　　缺锰在百合中不是很明显，而且它对植株生长的影响也不大。
　　症状：植株最顶端的新叶颜色变浅；叶尖有时会发黄或浅棕色。
　　解决方法：可通过给植株提供螯合态的锰或硫酸锰（MnSO4H2O）来解决。
　　4.毒害
　　在百合种植过程中，钾、镁、铁、铜、硼、钼元素的过量都不会在叶片上表现出什么症状。但锰元素的过量会使叶脉变为紫色，开始时在老叶叶尖上出现紫红色的小斑点。锰过量会在土壤蒸汽消毒后发生，当土壤pH低时更为严重。这种情况可通过在土壤中加入石灰来进行平衡（至少要等1周后才能种植），将土壤的pH值升高到6.5以上，或至少要等待3周以后再种植。如果土壤中钙元素的水平高会造成植株对铁、磷和镁元素吸收的阻遏。